La estación está situada entre las estaciones de Fuente de la Mora y Aeropuerto T4 y el tiempo de viaje entre Valdebebas y Atocha será de 26 minutos.

Mientras que el viaje a Nuevos Ministerios será de 19 minutos, de 12 a la Estación de Chamartín y a la terminal 4 del aeropuerto Adolfo Suárez Madrid Barajas de 3 minutos.

La frecuencia de paso de trenes por Valdebebas, estación que se enmarca en la zona tarifaria A, será de 30 minutos. El primer tren dirección Príncipe Pío saldrá de la nueva estación a las 6.02 horas. El último, a las 00.18 horas. En dirección hacia el Aeropuerto T4, el primero será a las 5.38 horas, mientras que el último tren pasará por la nueva estación a las 00.09 horas.

Así, la parada de Valdebebas se suma como nueva parada de la C-1, que presta servicio en las estaciones de Príncipe Pío, Pirámides, Delicias, Méndez Álvaro, Atocha, Recoletos, Nuevos Ministerios, Chamartín, Fuente de la Mora y Aeropuerto T-4.

Renfe explica que el servicio en la línea C-1 se presta por medio de los trenes Civia, diseñados con espacios diáfanos y luminosos, y que incorporan un coche intermedio con un área de piso bajo adaptado para las personas con movilidad reducida, sitio para bicicletas y aseos.

La puesta en marcha del servicio de trenes en la nueva estación de Valdebebas se suma al ya inaugurado apeadero de Soto del Henares, y se enmarca dentro del Plan de Mejoras de Cercanías.

La estación de Valdebebas está situada en el desarrollo urbanístico del mismo nombre, en el barrio de Valdelasfuentes, al lado de los Ciudad Deportiva del Real Madrid y cerca del Campo de las Naciones y los recintos feriales, Sanchinarro y colindante con Barajas.

Añade Renfe que Valdebebas es una estación subterránea que cuenta con «modernas instalaciones». Es accesible para personas con movilidad reducida (está dotada con ascensores y escaleras mecánicas) y cuenta con controles de acceso, sistemas de información  a los viajeros, venta de billetes en ventanilla y máquinas autoventa.

Fue construida en 2011 pero permanecía cerrada hasta alcanzar el nivel adecuado de desarrollo urbanístico, según detallaron en su momento desde Adif. La ministra de Fomento, Ana Pastor, ya adelantó la puesta en funcionamiento de la estación.